永州市農業局是永州市工作部門之一。機關內設辦公室、政工科、發展計劃與財務科、政策法規與科技教育科、糧油作物科、經濟作物科、蔬菜科、農業行政執法支隊、市場信息科、室10個行政科室支隊及直屬機關黨委，土壤肥料工作站、農技推廣站、國營農場管理站、湖南省農業廣播電視學校永州分校、植保植檢站、農業利用外資外經辦、種子管理站、農業環境監測管理站、農產品質量檢驗檢測中心9個事業站校中心。現有干部職工106人，其中高級職稱技術干部10人，中級職稱技術干部23人。局屬單位有永州市農科所、零陵柑桔示范場和永州市鄉鎮企業局。
近年來，在市委、市政府的堅強領導和市人大、市政協以及社會各界的監督支持下，市農業局認真履行職責，不斷改進工作作風，開拓進取，真抓實干，為促進全市農業提質增效、農民持續增收做了大量工作，取得了顯著成效。2007年以來，農情信息、農業資源與環境保護、農產品質量監管、農產品質量檢驗檢測、植保植檢、農業污染源普查等工作獲省級以上先進單位榮譽稱號32項次；黨委辦公室信息、督查、綜合調研、抗冰救災、辦理人大代表建議政協委員提案等工作多次被市委、市政府評為先進單位。2008年-2011年全市獲全國糧食生產先進縣、全省糧食生產先進市州、全省糧食生產標兵縣和先進縣榮譽稱號16個。